Rejeição 239: Versão do arquivo XML não suportada
Falha
Quando emitido uma "MDF-e", onde o cabeçalho do arquivo que está sendo enviado não estiver de acordo com os padrões exigidos pela SEFAZ, retornará à rejeição 239. De acordo com a mudança de layout, houve a necessidade de alteração do cabeçalho nos arquivos que são enviados para o Web Service da SEFAZ.

Solução
Neste caso, deve ser realizada a atualização do layout ajustando os conteúdos do cabeçalho. Além disso, o XML deve estar de acordo com as exigências da NT 2016.002.
Outras informações
Fonte: MOC MDF-e 3.00a - Visão Geral