Rejeição 560: CNPJ base/CPF do emitente difere do CNPJ base/CPF da primeira NF-e do lote recebido (NFC-e)
Falha
Ao se deparar com a Rejeição (560): “CNPJ base do emitente difere do CNPJ base da primeira NF-e do lote recebido”, significa que foi gerado um lote de notas para a SEFAZ, das quais uma delas contém um CNPJ do emitente diferente da primeira nota do lote. Ou seja, o lote deve conter somente notas do mesmo CNPJ emitente.

Solução
Em um envio de lote de NF-e's haviam 5 notas, cujo o CNPJ do emitente era 06255692000103, porém em uma dessas notas, o CNPJ emitente foi informado de forma errônea, com os dígitos 06255692000104, desta forma, causando a rejeição. Deve-se corrigir a nota que está com o CNPJ incorreto e reenviar o lote para o devido processamento.
Como será exibido no e-Monitor

Outras informações
Fonte: ------> Anexo I - Leiaute e Regra de Validação - NF-e e NFC-e